第6章　エメラルド編（通巻版26〜29巻）

「ポケモンが好きじゃない」という異色のキャラクター、エメラルドが活躍する第六章。エメラルドが完全制覇をめざす「バトルフロンティア」は、『ポケモン エメラルド』で登場したホウエン地方の新施設だ。さまざまなルールで行われるポケモンバトルに挑戦する一方、幻のポケモン・ジラーチを保護しようとするエメラルドだが、不気味な「鎧の男」が現れて…!?